高港区境域在周秦时代即为海阳（今泰州）邑地。汉武帝无元狩六年（公元前117年）为海陵县地。有史记载追溯至五代南唐升元元年（937年）。清康熙《扬州府志》云：“南唐析济川镇置泰兴县，创治于柴墟。宋初徙治延令村，是为今县治。”柴墟是口岸的古称。南宋建炎四年（1130年），岳飞任通泰镇抚使兼知泰州，因泰州无险可恃退保柴墟，在南坝桥大败金兵。绍兴十年（1140年），泰州的治所曾一度移至柴墟。元末，徐达为进攻泰州，自境内大江口开浚河道直至泰州南门。明嘉靖年间（1522～1566年），泰州至泰兴的驿道经过境内，并设刁家渡铺、口岸铺。明代，口岸成为泰兴的西北重镇，先后建有口岸察院、口岸公馆等。　　清代在口岸设巡检司，所治范围为泰兴县的西北片。清雍正十三年（1735年），泰兴全县分为四辖，口岸巡检司所治地域为“口辖”。口岸逐渐发展为长江北岸的一个重要港口和物资集散地。民国时期，区境各乡镇分属泰兴、泰县。民国38年（1949年）4月，中国人民解放军第三野战军副司令员兼副政委粟裕等，率司令部直属队抵达白马庙（今高港区白马镇），设立东突击集团渡江作战指挥部。4月23日，成立中国人民解放军华东军区海军司令部，张爱萍任司令员兼政委。白马庙成为中国人民解放军海军诞生地。　　1997年8月，国务院批准设立泰州市高港区，时辖7个乡镇（永安洲、田河、口岸、刁铺、许庄、白马、野徐）。2008年区划调整，辖口岸、刁铺、许庄3个街道及永安洲、野徐、白马3个镇，代管泰兴市胡庄镇、姜堰市大泗镇及两市部分行政村，野徐镇2个村、白马镇1个村划归泰州市周山河街区代管。2009年区划调整，辖口岸、刁铺、许庄3个街道及永安洲、白马、胡庄、大泗4个镇，许庄街道2个村划给野徐镇，调整后的野徐镇及刁铺街道部分村组划归泰州经济开发区代管。　　高港区是泰州市区的南大门，是中国人民解放军海军诞生地。设有省级高新技术产业园（原泰州高港科技创业园）。境内有长江港口泰州港和南水北调枢纽工程引江河，有国电电厂及在建中的泰州长江大桥，有G2京沪高速、G40京陕高速、S336省道穿境，水陆交通便捷。全区有以花卉苗木、特水养殖为龙头的农业生产基地。形成物流、化工、医药、船舶、机电、食品六个产业群，境内有扬子江药业、梅兰化工、海企仓储、益海粮油、口岸船舶、德国贺尔碧格齿轮、永盛包装、奔仙睡衣、三泰啤酒等知名企业。江鲜、全羊席名声在外，肯德基、义乌大市场入驻。　　高港区在区委、区政府的正确领导下,城市配套设施齐全,环境优美,功能完备,一个充满活力和生机的滨江花园式港口城市正在崛起。